Saat ini UNU Kaltim memiliki beberapa program studi, sesuai dalam rencana Tahap Awal di 2014, antara lain :
- Teknik Arsitektur
- Teknik Industri
- Teknik Informatika
- Teknik Industri Pertanian
- Hubungan Internasional
- Akuntansi
- Komunikasi
- Farmasi
- Desain interior
- Pendidikan Guru Anak Usia Dini
Secara Jangka Panjang, program program studi akan terus berkembang mengikuti rencana jangka menengah dan jangka panjang, berupa pembukaan program studi baru dan jenjang yang lebih tinggi